MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444 chromosome

Total Repeats: 77951

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007794	GAA	2	6	27	32	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	87198027
2	NC_007794	GGC	2	6	81	86	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	87198027
3	NC_007794	GC	3	6	89	94	0 %	0 %	50 %	50 %	87198027
4	NC_007794	CAGG	2	8	96	103	25 %	0 %	50 %	25 %	87198027
5	NC_007794	AAG	2	6	105	110	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	87198027
6	NC_007794	AAG	2	6	189	194	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	87198027
7	NC_007794	GCTCG	2	10	239	248	0 %	20 %	40 %	40 %	87198027
8	NC_007794	CCGA	2	8	285	292	25 %	0 %	25 %	50 %	87198027
9	NC_007794	CGT	2	6	399	404	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	87198027
10	NC_007794	CGGCG	2	10	425	434	0 %	0 %	60 %	40 %	87198027
11	NC_007794	GCCGC	2	10	448	457	0 %	0 %	40 %	60 %	87198027
12	NC_007794	CGC	2	6	464	469	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	87198027
13	NC_007794	CGC	2	6	569	574	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	87198027
14	NC_007794	CGC	2	6	610	615	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	87198027
15	NC_007794	GCC	2	6	681	686	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	87198027
16	NC_007794	TCT	2	6	706	711	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	87198027
17	NC_007794	GAT	2	6	767	772	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	87198027
18	NC_007794	TGC	2	6	805	810	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	87198027
19	NC_007794	CGA	2	6	815	820	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	87198027
20	NC_007794	TCA	2	6	829	834	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	87198027
21	NC_007794	AGG	2	6	853	858	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	87198027
22	NC_007794	TCC	2	6	862	867	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	87198027
23	NC_007794	TGA	2	6	883	888	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	87198027
24	NC_007794	TCG	2	6	904	909	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	87198027
25	NC_007794	GCC	2	6	912	917	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	87198027
26	NC_007794	CCAG	2	8	995	1002	25 %	0 %	25 %	50 %	87198027
27	NC_007794	TGG	2	6	1123	1128	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	87198027
28	NC_007794	CAA	2	6	1136	1141	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	87198027
29	NC_007794	GAA	2	6	1194	1199	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	87198027
30	NC_007794	CCG	3	9	1226	1234	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	87198027
31	NC_007794	CGA	2	6	1244	1249	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	87198027
32	NC_007794	GCGCC	2	10	1307	1316	0 %	0 %	40 %	60 %	87198027
33	NC_007794	CG	3	6	1317	1322	0 %	0 %	50 %	50 %	87198027
34	NC_007794	TCGT	2	8	1324	1331	0 %	50 %	25 %	25 %	87198027
35	NC_007794	CGC	2	6	1369	1374	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	87198027
36	NC_007794	CGG	2	6	1403	1408	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	87198027
37	NC_007794	GC	3	6	1457	1462	0 %	0 %	50 %	50 %	87198027
38	NC_007794	GAC	2	6	1631	1636	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	87198028
39	NC_007794	CGCC	2	8	1682	1689	0 %	0 %	25 %	75 %	87198028
40	NC_007794	GGC	2	6	1764	1769	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	87198028
41	NC_007794	GCGGGC	2	12	1797	1808	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	87198028
42	NC_007794	CGA	3	9	1829	1837	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	87198028
43	NC_007794	GAA	2	6	1881	1886	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	87198028
44	NC_007794	GCG	2	6	1911	1916	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	87198028
45	NC_007794	GCA	2	6	1917	1922	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	87198028
46	NC_007794	CG	3	6	1928	1933	0 %	0 %	50 %	50 %	87198028
47	NC_007794	CGGG	2	8	1976	1983	0 %	0 %	75 %	25 %	87198028
48	NC_007794	CGT	2	6	2015	2020	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	87198028
49	NC_007794	GGC	2	6	2273	2278	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	87198028
50	NC_007794	CTG	2	6	2289	2294	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	87198028
51	NC_007794	TCG	2	6	2425	2430	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	87198029
52	NC_007794	GTGCG	2	10	2540	2549	0 %	20 %	60 %	20 %	87198029
53	NC_007794	GCC	2	6	2560	2565	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	87198029
54	NC_007794	CGT	2	6	2621	2626	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	87198029
55	NC_007794	TGG	2	6	2706	2711	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	87198029
56	NC_007794	GC	3	6	2742	2747	0 %	0 %	50 %	50 %	87198029
57	NC_007794	CATG	2	8	2783	2790	25 %	25 %	25 %	25 %	87198029
58	NC_007794	GCA	2	6	2792	2797	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	87198029
59	NC_007794	GTC	2	6	2826	2831	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	87198029
60	NC_007794	ATG	2	6	2904	2909	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	87198029
61	NC_007794	CGC	2	6	2944	2949	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	87198029
62	NC_007794	CG	4	8	2981	2988	0 %	0 %	50 %	50 %	87198029
63	NC_007794	GGT	2	6	3020	3025	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	87198029
64	NC_007794	GCC	2	6	3036	3041	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	87198029
65	NC_007794	CGG	2	6	3071	3076	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	87198029
66	NC_007794	ACG	2	6	3097	3102	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	87198029
67	NC_007794	ATC	2	6	3173	3178	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	87198030
68	NC_007794	GGC	2	6	3211	3216	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	87198030
69	NC_007794	CGG	2	6	3244	3249	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	87198030
70	NC_007794	GC	3	6	3321	3326	0 %	0 %	50 %	50 %	87198030
71	NC_007794	CGC	2	6	3343	3348	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	87198030
72	NC_007794	ACG	2	6	3380	3385	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	87198030
73	NC_007794	TGC	2	6	3441	3446	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	87198030
74	NC_007794	GCT	2	6	3475	3480	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	87198030
75	NC_007794	GCC	2	6	3500	3505	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	87198030
76	NC_007794	GC	3	6	3506	3511	0 %	0 %	50 %	50 %	87198030
77	NC_007794	TCG	2	6	3537	3542	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	87198030
78	NC_007794	GCT	3	9	3586	3594	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	87198030
79	NC_007794	GCG	2	6	3618	3623	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	87198030
80	NC_007794	GAG	2	6	3635	3640	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	87198030
81	NC_007794	GC	3	6	3671	3676	0 %	0 %	50 %	50 %	87198030
82	NC_007794	GCC	2	6	3698	3703	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	87198030
83	NC_007794	GCG	2	6	3708	3713	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	87198030
84	NC_007794	CG	3	6	3791	3796	0 %	0 %	50 %	50 %	87198030
85	NC_007794	GCT	2	6	3832	3837	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	87198030
86	NC_007794	GCG	2	6	3970	3975	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	87198031
87	NC_007794	CTGGCG	2	12	4006	4017	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	87198031
88	NC_007794	ATC	2	6	4087	4092	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	87198031
89	NC_007794	CTGG	2	8	4113	4120	0 %	25 %	50 %	25 %	87198031
90	NC_007794	CG	3	6	4142	4147	0 %	0 %	50 %	50 %	87198031
91	NC_007794	GCG	2	6	4150	4155	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	87198031
92	NC_007794	CTT	2	6	4176	4181	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	87198031
93	NC_007794	TGC	2	6	4196	4201	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	87198031
94	NC_007794	TGG	2	6	4228	4233	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	87198031
95	NC_007794	GACC	2	8	4254	4261	25 %	0 %	25 %	50 %	87198031
96	NC_007794	GTG	2	6	4333	4338	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	87198031
97	NC_007794	CTGG	2	8	4347	4354	0 %	25 %	50 %	25 %	87198031
98	NC_007794	GCG	2	6	4356	4361	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	87198031
99	NC_007794	CGC	2	6	4364	4369	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	87198031
100	NC_007794	TGG	2	6	4375	4380	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	87198031
101	NC_007794	GCG	3	9	4411	4419	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	87198031
102	NC_007794	CCAG	2	8	4467	4474	25 %	0 %	25 %	50 %	87198031
103	NC_007794	ACG	2	6	4553	4558	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	87198031
104	NC_007794	CTCG	2	8	4650	4657	0 %	25 %	25 %	50 %	87198031
105	NC_007794	GC	3	6	4665	4670	0 %	0 %	50 %	50 %	87198031
106	NC_007794	GGC	2	6	4715	4720	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	87198031
107	NC_007794	TGG	2	6	4751	4756	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	87198031
108	NC_007794	CCG	2	6	4985	4990	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	87198031
109	NC_007794	GGA	2	6	5019	5024	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	87198031
110	NC_007794	TCT	2	6	5030	5035	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	87198031
111	NC_007794	ACCC	2	8	5038	5045	25 %	0 %	0 %	75 %	87198031
112	NC_007794	GGC	2	6	5067	5072	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	87198031
113	NC_007794	CG	3	6	5125	5130	0 %	0 %	50 %	50 %	87198032
114	NC_007794	TTC	2	6	5145	5150	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	87198032
115	NC_007794	CGAC	2	8	5245	5252	25 %	0 %	25 %	50 %	87198032
116	NC_007794	CAA	2	6	5261	5266	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	87198032
117	NC_007794	CGC	2	6	5299	5304	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	87198032
118	NC_007794	CATGGC	2	12	5387	5398	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	87198032
119	NC_007794	GCCG	2	8	5432	5439	0 %	0 %	50 %	50 %	87198032
120	NC_007794	CTG	2	6	5448	5453	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	87198032
121	NC_007794	CGT	2	6	5489	5494	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	87198032
122	NC_007794	AC	3	6	5533	5538	50 %	0 %	0 %	50 %	87198032
123	NC_007794	CGC	2	6	5584	5589	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	87198032
124	NC_007794	AGC	2	6	5602	5607	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	87198032
125	NC_007794	CAC	2	6	5646	5651	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	87198032
126	NC_007794	GGT	2	6	5714	5719	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	87198032
127	NC_007794	GAA	2	6	5777	5782	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	87198032
128	NC_007794	AAG	2	6	5796	5801	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	87198032
129	NC_007794	CGC	3	9	5839	5847	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	87198033
130	NC_007794	GCC	2	6	5867	5872	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	87198033
131	NC_007794	ACG	2	6	5889	5894	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	87198033
132	NC_007794	CGT	2	6	5923	5928	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	87198033
133	NC_007794	CGA	2	6	5983	5988	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	87198033
134	NC_007794	CAT	2	6	6118	6123	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	87198033
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136	NC_007794	GCC	2	6	6293	6298	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	87198034
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